Après des études au Conservatoire de Paris, elle reçoit à Vienne l’enseignement de Paul Badura-Skoda, de Jörg Demus et surtout d’Alfred Brendel. Les succès remportés dans les concours internationaux de Munich et Leeds ne tardent pas à faire d’elle une soliste en vue invitée à travers le monde.

Plébiscitée dans le monde entier (notamment en Europe, au Japon, Hong kong, au Canada, aux États-Unis), elle se produit sous la direction de grands chefs et avec des orchestres tels que le London Symphony, London Philharmonic, Philharmonia Orchestra, BBC Symphony, Academy of St. Martin in the Fields, Tonhalle de Zurich, Orchestre de chambre de Pologne, de Lausanne, Tokyo NHK Orchestra, Ensemble Kanazawa, Hongkong Philharmonic, Orchestres National de France et Philharmonique de Radio France, Strasbourg, Lille, Philharmonie de Prague, Kremerata Baltica.

Elle a participé à la bande sonore d’Amadeus, sous la direction de Neville Marriner, a donné l’intégrale des Sonates de Mozart en direct sur France Musique au Festival de la Roque d’Anthéron, confirmant son affinité passionnée avec l’univers mozartien. Anne Queffélec est à l’affiche de nombreux festivals français et étrangers.

À la scène comme pour ses enregistrements, Anne Queffélec cultive un répertoire éclectique de Haendel à Dutilleux. Elle a consacré plus d’une trentaine d’enregistrements gravés respectivement chez Erato, Virgin Classics, Mirare.

Parmi ses derniers disques : « Satie & Compagnie » un album gravé chez Mirare élu « Diapason d’Or » de l’année 2013, suivi d’un double CD « Ravel, Debussy, Fauré » paru chez Erato en 2014 et d’« Ombre et Lumière » consacré à Domenico Scarlatti chez Mirare en 2015. Ces derniers disques remportent à nouveau un immense succès ; ils sont tous deux distingués par un "Diapason d’Or".